全金属車体となった300番台車と、それ以前の半鋼製車体の80系各車とでは、車体構造や側窓寸法の相違から基本塗り分けラインが異なり、両者の混結時には美観の点で難があった。そこで、一部の国鉄工場では担当電車区に在籍する80系について、在来車の塗り分けを300番台車のものに揃える例や、在来車と300番台の折衷ラインに統合する例など、その塗装管理について試行錯誤を繰り返した。

しかしこの塗り分け調整には、結局統一された決定版が生じなかった。その後80系の広域転配で見解の異なる工場の担当車同士が併結される例も見られ、この場合は編成全体のラインの乱れが却って悪化した。