単式ホーム1面1線の駅である。ホーム上には待合室などない、無人駅である。

当駅は鹿児島交通が廃線になるまで国鉄の駅数にカウントされなかった（現在の綾瀬駅、和歌山市駅、姪浜駅と同様）。

2006年5月1日、駅が100m鹿児島寄りに移設された。これは元の駅敷地が、地元スーパーマーケットのタイヨーに売却されたためで、移設に先立ち駅舎は同年3月に解体されている。跡地にはタイヨー枕崎店が移転。なお、移設した場所に駅舎は設置されておらず、JR最南端線の終着駅としては侘しい駅となってしまった。