高速バス昼行の長距離では、たとえ格安であっても新幹線の速度と定時性にはかなわないものがあるが、既出の例を含む中距離区間や、新幹線が中心とされた東京・大阪間を初めとする区間を夜行バスで寝ている間に格安で移動できるということで、1980年代ごろから人気が出ており、国鉄の名残からJR新幹線沿線をJRの子会社が運行する路線もあるが（東京-名古屋・京阪神間が中心）、JRグループ以外の競合会社（私鉄・専業系路線バスのほか、貸切バスによる会員制ツアーバスもある）の進出も急増し、各JR新幹線と実質競合している。高速バスは、バスの特性を生かして都市の市街地（東京の新宿や渋谷、名古屋の栄、大阪の梅田や難波、広島の紙屋町、福岡の天神など）やテーマパーク（TDRやUSJなど）に直接乗り入れるなどしているため、新幹線の駅を結ぶ競合でなくても新幹線の客を奪っているのである（ただ、運賃と所要時間が違いすぎるため、直接的な新幹線との競合というよりは、利用客のニーズの違いで使い分けられている感が大きい）。なおJR新幹線は協定により深夜・早朝の運転を行わない。