上記のように、1950年代より皇族や首相、閣僚の海外公式訪問や国内移動の際に日本航空の特別機が頻繁に使用されており、これを受けて特別機専用機材が常に複数機割り振られてあり、必要になった際にはこれらの機材が政府によりチャーターされ、特別機として運航されている。また、ハイジャックや邦人誘拐などの事件の際しての特別機やチャーター機の運航も行われていた。