下級裁判所の裁判官は、最高裁判所の指名した者の名簿によって内閣が任命する（憲法80条1項、裁判所法40条1項）。

このうち、高等裁判所長官は、任免に天皇の認証を受ける認証官である（裁判所法40条2項）。

2003年から、法曹三者6名・学識経験者5名から成る下級裁判所裁判官指名諮問委員会が、最高裁判所の諮問を受けて答申・報告を行う制度が導入されている<ref>下級裁判所裁判官指名諮問委員会（裁判所）</ref>。