• 副都心線の営業キロは小竹向原 - 渋谷間のもので、有楽町線との共用区間は含まない。
• 有楽町線のうち和光市 - 小竹向原間は、東京圏鉄道網整備計画などでは13号線（副都心線）の一部となっており、東京地下鉄によると副都心線の起点駅は和光市となっている。そのため、和光市 - 小竹向原間は有楽町線と副都心線の共有区間となっている。なお、副都心線開業前は、先行開業していた小竹向原 - 新線池袋（現・池袋）間を有楽町線新線として営業していた。
• 路線番号に欠番（1・6・10・12号線）があるのは、都営地下鉄と共通の連番にしているためである。

銀座線と丸ノ内線は標準軌（軌間1,435mm）第三軌条方式（直流600V）、それ以外の路線は他社線との相互乗り入れを行うため狭軌（軌間1,067mm）架空電車線方式（直流1,500V）による電気鉄道である。また、車両の大きさも銀座線が小型車（16m級）、丸ノ内線と日比谷線が中型車（18m級）、その他の線区が大型車（20m級）と、建設時期や他社乗り入れ車両の関係から線区ごとに異なっている。

なお、東京地下鉄では起点から終点に向かう下り線を「A線」、終点から起点に向かう上り線を「B線」と呼んでいる。ただし、銀座線に限り渋谷→浅草が下り、浅草→渋谷が上りとなる。駅ではホームの番号が若い方をA線としている（綾瀬・中野坂上および半蔵門線各駅を除く自社管理駅に限る）。また、列車番号では上下で奇数偶数の区別をしていないため、直通のない銀座・丸ノ内線を除いて「A○○△△S」「B○○△△K」（○○はその列車の始発「時」、△△は運用番号、末尾のアルファベットは車両の所属元の符号）のように頭にA・Bが付く。

ちなみに、2004年の発足時に導入された駅番号（駅ナンバリング）は、基本的に西・南から東・北方面に向かって振られており、路線によっては起点ではなく終点側の駅が「01」である場合もある点に注意が必要である。上表では左側の駅が起点である。なお、各線の記事の駅一覧では駅番号順で記載しているので注意されたい。