経営状況は、2004年（平成16年）度は全国最悪の約134億7,000万円の赤字、2005年度で約38億7300万円赤字と、長年赤字に苦しんでいた。しかし近年、赤字幅は大幅に減少してきており、地下鉄事業を始めてから47年目である2006年度には、31億3,200万円の経常黒字を計上した。また、経営計画「新チャレンジ2007」によると、2007年度も黒字になると書かれている。

また、2005年度までの累積欠損金は約4,772億円にのぼる。このため、過去に財政再建団体に転落したことがある。