1789年からフランス本国では革命が勃発し、サン＝ドマングの黒人奴隷とムラート（混血の自由黒人）たちはその知らせを聞いて、1791年に蜂起した。

トゥーサン・ルーヴェルチュール、ジャン＝ジャック・デサリーヌ、アンリ・クリストフらに率いられた黒人反乱軍は白人の地主を処刑した後、フランスに宣戦布告したイギリスとスペインが、この地を占領するため派遣した軍を撃退し、サン＝ドマング全土を掌握した。ルーヴェルチュールは1801年に自らを終身総督とするサン＝ドマングの自治憲法を交付し、優れた戦略と現実的な政策により戦乱によって疲弊したハイチを立て直そうとしたがしかし、奴隷制の復活を掲げたナポレオンが本国から派遣したシャルル・ルクレールの軍によって1802年に反乱は鎮圧され、指導者ルーヴェルチュールは逮捕されフランスで獄死した。

ところが、新たな指導者デサリーヌの下で再蜂起した反乱軍は、イギリスの支援を受けて、1803年にフランス軍をサン＝ドマング領内から駆逐した。そして、1804年1月1日に独立宣言をし、ハイチ革命が成功した。

デサリーヌは国名を先住民のつけた名であったハイチに変更し、ナポレオンに倣って皇帝として即位し、残った白人を追い出した。彼は1805年に憲法を制定したが、北部のアンリ・クリストフと南部のアレクサンドル・ペションらの勢力に圧迫され、1806年に暗殺される。ジャン＝ジャック・デサリーヌは今日もハイチ建国の父として敬愛されている。