紀元前4000年から1000年までの間に先住民アラワク人（タイノ人）が南アメリカ大陸のギアナ地方から移住してきた。タイノ人は島をアイティ（Haiti）、ボイオ（Bohio）、キスケージャ（Quesquiya）と呼び、島は五つのカシーケ（酋長）の指導する部族集団に分かれていた。ヨーロッパ人の征服によりアラワク人は消え去った。征服時にいたインディオの数は、イスパニョーラ島の全てを併せるとおよそ100万人から300万人程だろうと推測されている。