国内外の民間航空の発展に伴い、北東アジアにおけるハブ空港としての発展が期待されたものの、その後1937年に日中戦争がはじまり、1941年12月に日本がイギリスやアメリカ、オランダなどとの連合国との間に開戦すると民間航空は事実上停止し、軍用飛行場として使用されることとなった。

これ以降終戦までの間は、国内線の他に香港やジャカルタ、マニラやシンガポールなど、これまで欧米諸国の植民地であったが、その後日本軍が占領した東南アジア各都市へ向けて、陸軍特務航空輸送部が定期便を就航させることとなった（大日本航空が委託運航していた）。なお、第二次世界大戦末期には日本本土を空襲する連合国軍の航空機の爆撃目標となったため、空港内外に対空砲などが置かれた。