島嶼県であるという事情から、県外への移動や県内離島間の移動は空路が主に利用されている。県内には、以下の表の空港と伊是名場外離着陸場があり、また、在日米軍が基地として利用する嘉手納飛行場、普天間飛行場などがある。

• 出典は国土交通省航空局・空港管理状況調書（2005年度）
• 就航先は2008年4月1日現在
• チャーター便の旅客数含む
• 括弧は通年運航ではない（季節運航もしくは運休期間がある）路線を示す
• 三大都市圏への便は太字