本作は社会現象にまでなった1990年代を代表するアニメ作品であり、蓄積された邦画や日本の特撮、アニメーションの技法を濃縮した作風に加え、キャラクターの内的側面を表現するなど、斬新な演出が後続するアニメ作品に多大な影響を与えた（アニメ作品以外にもこの傾向はみられる）ことから<ref>ゲーム雑誌『電撃PlayStation』が新劇場版の特集を行った時にこの「各業界への影響」について触れている。そこでゲームクリエイターに対して行われたインタビュー・アンケートでも「本作の影響を受けた」とする回答が多く見られた。また、宇野常寛の著作『ゼロ年代の想像力』においても1990年代の社会全体を覆う『気分』（オウム真理教などに代表される破滅（アルマゲドン）思想、引きこもりの思想、若者の成熟問題）を代表する作品として取り上げ、1990年代後半以降のセカイ系諸作品に対する影響性が検証されている。その他には東浩紀の著書や雑誌『月刊ニュータイプ』2007年11月号、サブカルチャー雑誌（）など多数。 また、テレビドラマ『踊る大捜査線』も本作から演出に関して複数のモチーフを得ていることで知られる（2007年8月30日放送『めざましテレビ』内ヱヴァ特集冒頭での軽部真一の発言「踊る大捜査線など様々な作品に影響を与えた〜」など）。</ref>、1970年代を代表する『宇宙戦艦ヤマト』、1980年代を代表する『機動戦士ガンダム』に続く第3次アニメ革命と言われた<ref>「シト新生」予告内の文。または</ref>。従来のロボットアニメが玩具の売り上げのための販促としての性格を色濃く持っていたのに対し<ref group="†">多くのロボットアニメは玩具メーカーがメインスポンサーとなっており玩具の売り上げが作品にも大きな影響を与える。『エヴァ』のスポンサーには玩具メーカーがついていないがこれは監督である庵野の意向である（『月刊ニュータイプ』1995年4月号）。また、ロボットアニメの記事なども参照のこと。</ref>、アニメ作品の映像ソフト自体に販売、購入価値を見出せる作風であり、本作以後、「パッケージ性」と呼ばれるこの性格を強めテレビアニメの制作費を映像ソフト化で賄う仕組みができた<ref></ref>。

コンテンツ業界では元々一つのメディアでしか表現されていなかった作品（原作）の商品広告を小説、漫画、アニメ、ゲーム、音楽CD、映画、キャラクターグッズ販売などの多数のメディアと組み合わせて商品展開させ各メディアの弱点を補う「メディアミックス」と呼ばれる手法が1980年代後半から盛んになっていた。本作品は同時期の『スレイヤーズ』シリーズ、『機動戦艦ナデシコ』と共にその潮流を確立させたものであり、特に「原作のないアニメ主体のメディアミックス」の嚆矢となった存在である<ref>『月刊ニュータイプ』1995年1月号庵野秀明と貞本義行の対談。</ref>。

この作品の成功はアニメブームに繋がり、放送後の1997年頃からは首都圏でテレビアニメが週約50本放送される空前のブームとなった。本番組の深夜帯再放送における高視聴率をきっかけにアニメの深夜放送（いわゆるの100%出資により経済的リスクも全て負うことになった（『サブラ』15号）。</ref>。

また物語終盤にいくにつれ、社会やそれに関わる人々がほとんど描写されることなく、主人公・碇シンジのとる行動や内面性がそのまま「世界の危機」にシンクロして描かれる。このような、「悩める主人公の精神世界と現実世界がシンクロし、世界の命運を左右するかのような設定」は、後にセカイ系と呼ばれるジャンルの形成に大いに寄与し<ref>ニュータイプ2006年10月号</ref>、別名「ポスト・エヴァンゲリオン症候群」と呼ばれることがある<ref>このライトノベルがすごい!2005. 宝島社, p.140</ref>。