単系統に属し、他の系統と異なる特徴、進化的傾向を持つ生物群や系統を種とする。この場合、進化的傾向は恣意的であること、個体群と真の種の間の区別ができない事などが問題となる<ref>エルンスト・マイア 『進化論と生物哲学』pp309-310 東京化学同人</ref>。