2001年9月11日の午前、イスラム系国際テロ組織アルカイダ実行犯がハイジャックした民間航空機二機が両タワーに次々に自爆突撃をした。テロリスト含む乗員・乗客・テナント・消防・警察など、あわせて2749人もの死亡者を出す惨事となった。

WTC建造物への被害は以下のとおり：

• 1WTC：ノースタワー（110階） → 94–98階にアメリカン航空11便（ボーイング767-200 N334AA）が直撃、完全崩壊
• 2WTC：サウスタワー（110階） → 78–84階にユナイテッド航空175便（ボーイング767-200 N612UA）が直撃、完全崩壊
• 3WTC：マリオットホテル（22階） → 2WTC崩壊により半壊、1WTC崩壊でほぼ全壊
• 4WTC：オフィスビル（9階） → 2WTC崩壊によりほぼ全壊
• 5WTC：オフィスビル（9階） → 9階から3階まで両タワー崩壊によりほぼ全壊
• 6WTC：合衆国関税局/先物取引場（7階） → 両タワー崩壊によりほぼ全壊
• 7WTC：オフィスビル（47階） → テロ発生8時間後に完全崩壊