大統領を国家元首とする連邦共和制国家であり、大統領は行政府の長である。国民の直接選挙によって選出され、任期は6年、再選は禁止されている。現大統領は、国民行動党 (PAN) フェリペ・カルデロン（任期：2006年12月1日 - 2012年11月30日）。大統領の権限は絶大で、憲法は三権分立を規定するが、事実上、立法府も司法府も大統領の統制下にある。また、軍部も大統領の下でのシビリアンコントロールが制度的に確立している。

大統領は、行政各省の大臣を指名する。ただし、司法相のみは、上院の承認が必要である。各大臣は大統領直属の地位にあり、大統領に対し責任を負うのみで、議会や国民に対して責任は負わない。副大統領や首相という役職はなく、大統領が死亡などで欠ける場合は、議会が暫定大統領を選出する。

議会は、両院制（二院制）。上院（元老院）は、全128議席で、そのうち4分の3にあたる96議席が連邦区と州の代表（各3議席）、残りが全国区の代表である。それぞれ比例代表制で選出され、任期は6年。下院（代議院）は、全500議席で、300議席は小選挙区制、200議席は比例代表制。任期は3年。両院とも連続再選は禁止されている。

主要政党には、中道右派の国民行動党 (PAN)、長らく支配政党だった制度的革命党 (PRI)、左派の民主革命党 (PRD) の3つが挙げられる。他にも、サパティスタ民族解放戦線や、労働者党、メキシコ緑の環境党などの小政党が存在する。

なお、最南部グアテマラ国境地帯のチアパス州は、北米自由貿易協定（NAFTA）が発効された1994年1月1日に武装蜂起したサパティスタ国民解放軍による統治が続き、事実上の解放区となっている。