イーネット・アットバンクの場合、直接提携行であっても他行経由扱いになる場合がある。ゆうちょ銀行キャッシュカードの場合も、幹事行や利用時間帯によっては幹事行以外の他行経由扱いになったり、入金ができないケースなどがある。

• 都市銀行
  • みずほ銀行ATM統括支店（支店コード・890）…みずほMMKの管理店はATM統括支店だが、MMKセンター（支店コード・942）で処理される
  • 三菱東京UFJ銀行エイティエム統括支店（旧BTMおよび新システム稼動店・支店コード323→389）<del>・エイティエム支店（旧UFJ・支店コード581→284）</del>
  • 三井住友銀行エーティーエム統括支店（支店コード・390）・エーティーエムサービス東日本第一支店（支店コード・607）・エーティーエムサービス西日本第一支店（支店コード・702）
  • りそな銀行東京エイティエム支店（支店コード・918）
  • 埼玉りそな銀行埼玉エイティエム支店（支店コード・918）
• 新たな形態の銀行
  • ジャパンネット銀行本店営業部（支店コード・001）…ただし、イーネット・アットバンクは三井住友銀行エーティーエム統括支店経由扱い
  • セブン銀行本店（支店コード・100）
  • ソニー銀行本店営業部（支店コード・001）…ただし、アットバンクは三井住友銀行エーティーエム統括支店経由扱い
  • イーバンク銀行本店（支店コード・101）
  • 住信SBIネット銀行本店（支店コード・100）
  • じぶん銀行本店（支店コード・001）
  • イオン銀行ATM管理店（支店コード・1xx番台）…設置拠点により支店コードが異なるが、機器左上に表示の勘定店番上4桁（0xxx）がこれにあたり、利用時の明細には0を除く3桁が表示される。

• 地方銀行
  • 北海道銀行本店営業部（支店コード101）・イーネットATM支店（支店コード・145）・ローソンATM支店（支店コード・146）
  • 青森銀行本店営業部（支店コード・101）・イーネット支店（支店コード・022）
  • みちのく銀行本店営業部（支店コード・014）
  • 秋田銀行本店営業部（支店コード・111）・本部（支店コード・801）…ただし、実際に処理を行う先の支店コードは711となっている
  • 荘内銀行ローソン支店（支店コード・250）
  • 山形銀行提携エーテイーエム支店（支店コード・831）
  • 岩手銀行本部（支店コード・601）
  • 東北銀行本店営業部（支店コード・101）
  • 七十七銀行本店営業部（支店コード・100）
  • 東邦銀行本店営業部（支店コード・101）
  • 群馬銀行コンビニエーティーエム支店（支店コード・905）
  • 足利銀行コンビニATMセンター（支店コード・323）
  • 常陽銀行本店営業部（支店コード・101）
  • 関東つくば銀行
  • 武蔵野銀行
  • 千葉銀行
  • 千葉興業銀行
  • 東京都民銀行本店営業部（支店コード・001）・楽天支店（支店コード・111）…一般の支店、およびハローアクセス支店は本店営業部扱い、楽天支店は楽天支店扱いに振り分けられる
  • 横浜銀行桜木町特別支店（支店コード・320）
  • 第四銀行ローソンATM支店（支店コード・191）
  • 北越銀行本店営業部（支店コード・020）
  • 山梨中央銀行
  • 八十二銀行提携エーテイーエム支店（支店コード・831）
  • 北陸銀行
  • 北國銀行
  • 福井銀行
  • 静岡銀行
  • スルガ銀行本店営業部（支店コード・640）・タウンネットワーク支店（支店コード・852）
  • 清水銀行
  • 十六銀行エイティエム統括支店（支店コード・805）
  • 百五銀行コンビニATM支店（支店コード・916）
  • 滋賀銀行
  • 京都銀行
  • 池田銀行
  • 泉州銀行
  • 近畿大阪銀行
  • 南都銀行
  • 紀陽銀行ATM統括支店（支店コード・152）
  • 鳥取銀行
  • 山陰合同銀行ATM支店
  • 中国銀行本店営業部（支店コード・101）
  • 広島銀行本店営業部（支店コード・001）
  • 山口銀行
  • 阿波銀行提携エーティーエム支店
  • 百十四銀行ATM統括支店
  • 伊予銀行本店営業部（支店コード・100）
  • 福岡銀行本店営業部（支店コード・100）
  • 佐賀銀行
  • 十八銀行
  • 親和銀行ローソンATM支店（支店コード・977）・コンビニATM統括支店（支店コード・981）
  • 肥後銀行
  • 大分銀行
  • 宮崎銀行
  • 琉球銀行本店営業部（支店コード・201）
  • 西日本シティ銀行本店営業部（支店コード・010）
• 信託銀行（かつての長期信用銀行含む）
  • 三菱UFJ信託銀行本店営業部（支店コード・110）
  • 住友信託銀行東京営業部（支店コード・410）
  • 新銀行東京本店（支店コード・100）
  • 新生銀行本店（支店コード・400）
• 外国銀行の日本法人
  • シティバンク銀行本店（支店コード・730）…2007年7月1日より
• 外国銀行(1)
  • <del>シティバンク、エヌ・エイ東京支店（支店コード・730）…2007年6月30日まで</del>
  • 香港上海銀行
  • 韓国外換銀行…ただし、アットバンクは三井住友銀行エーティーエム統括支店経由扱い
  • ブラジル銀行東京支店（支店コード・001）
  • ユニオン・バンク・オブ・カリフォルニア…セブン銀行にて、BTMU取次による開設口座のバンキングカードの利用が可能となっているが、Cirrus提携の海外発行カード扱いでの利用となる
  • ウリィ銀行東京支店
• 第二地方銀行
  • 北洋銀行本店営業部（支店コード・028）
  • <del>札幌銀行本店営業部（支店コード・001）…2008年10月13日まで</del>
  • きらやか銀行本店営業部（支店コード・001）
  • 北日本銀行本店営業部（支店コード・002）
  • 仙台銀行本店営業部（支店コード・201）
  • 福島銀行本店営業部（支店コード・110）
  • 東和銀行
  • 栃木銀行
  • 茨城銀行
  • 京葉銀行
  • 東日本銀行
  • 東京スター銀行本店営業部（支店コード・100）・ATM統括支店第一～第十七（支店コード・012～028）…ただし、ATM統括支店は支店コード順ではない
  • 神奈川銀行
  • 大光銀行
  • 長野銀行
  • 福邦銀行
  • 静岡中央銀行
  • 岐阜銀行
  • 愛知銀行イーネット支店（支店コード・976）
  • 名古屋銀行エイティエム支店（支店コード・158）
  • 中京銀行
  • 第三銀行
  • びわこ銀行
  • みなと銀行
  • トマト銀行
  • もみじ銀行
  • 西京銀行
  • 愛媛銀行ATM統括支店
  • 佐賀共栄銀行
  • 熊本ファミリー銀行本店営業部（支店コード・100）<del>…ただし、イーネットは福岡銀行本店営業部経由扱い</del>
  • 豊和銀行本店営業部（支店コード・001）
  • 宮崎太陽銀行
• 外国銀行(2)

ただし、管轄店の支店コードと明細に表示される支店コードが一致しないケースもある。

因みに、みずほMMKや三菱東京UFJ銀行（旧BTM）がイーネットにATM管理を委託しているATM、東京スター銀行の店舗外簡易型ATMなどもこれらの支店管轄となる。