一部の金融機関においては、自前のATMをコンビニエンスストア店内に設置するケースも存在する。これらは共同店舗形式のコンビニATMとは異なり、各金融機関単独の店舗外ATMの一つとされ、一般のATMと同様の手数料取り扱い・稼動時間帯となり、基本的に深夜には使用できない<ref>ただし、ファミリーマート店内の鹿児島銀行・宮崎銀行ATMについては、両行の一般のATMより稼動時間帯が延長されている。また、デイリーヤマザキの一部店舗設置の東京スター銀行ATMは24時間利用可能。</ref>ことから、「コンビニ内ATM」と呼ばれて区別される場合もある。

また、コンビニエンスストアの駐車場に店舗外ATMを設置するケースも見られる（足利銀行、百十四銀行、香川銀行など）が、これは設置形態や管理方法においてショッピングセンターなどに設けられる店舗外ATM（出張所）と同様の扱いであり、コンビニATMやコンビニ内ATMとは一線を画す。

コンビニ内ATMを設置している主な金融機関は下記の通り。（※印は1店舗にのみ設置）

• 都市銀行等
  • 三菱東京UFJ銀行（愛知県内の一部） - 旧東海銀行→旧UFJ銀行による設置
  • ゆうちょ銀行（ローソン・デイリーヤマザキの一部）
  • 東京スター銀行（サークルKサンクス<ref>ゼロバンクが展開されていない地域に設置されている場合がある。</ref>・デイリーヤマザキの一部）
  • JAバンク<ref>主として各地のJAにより運営される店舗に設置。詳細はJAバンク参照。</ref>
• 地方銀行・信用金庫・労働金庫
  • 北海道・東北 - ※北海道銀行、※北洋銀行、※帯広信用金庫、稚内信用金庫、みちのく銀行、東北銀行、※岩手銀行、※北日本銀行、盛岡信用金庫、荘内銀行
  • 関東 - ※群馬銀行
  • 中部 - 静岡銀行、清水銀行、※しずおか信用金庫、※静清信用金庫、※沼津信用金庫、※磐田信用金庫、※遠州信用金庫、※名古屋銀行、半田信用金庫、知多信用金庫、※豊田信用金庫、※碧海信用金庫、岡崎信用金庫、岐阜銀行、大垣共立銀行、※いちい信用金庫、※岐阜信用金庫、※西濃信用金庫、※桑名信用金庫、百五銀行、※第三銀行、三重銀行<ref>三重県にはアットバンクの主体である三井住友銀行の店舗がなく、三重銀行と三井住友銀行はATM相互開放を行っている。</ref>、※北伊勢上野信用金庫、※北陸銀行、北國銀行、北陸労働金庫、福井銀行
  • 近畿 - ※大阪信用金庫、※京都信用金庫、※京都中央信用金庫、※京都北都信用金庫、中兵庫信用金庫、但馬信用金庫
  • 中国・四国 - ※山陰合同銀行、もみじ銀行、※西中国信用金庫、阿波銀行、※四国銀行、高知銀行
  • 九州・沖縄 - 西日本シティ銀行、大分銀行、豊和銀行、宮崎銀行、鹿児島銀行、南日本銀行、※九州労働金庫、※琉球銀行、※沖縄銀行