アーリア人ゲルマン人で代々ルター派牧師の家系出身であり、かつ永世中立国スイスのドイツ語圏に属するチューリッヒ大学講師カール・グスタフ・ユングに特別の期待をかけ、ユングも初めはフロイトを深く敬愛した。
フロイトの著作『夢判断』は、はじめ読者が限られていたものの、ユングがこれに目を通し、フロイトの主張を支持することを決意したという。

1910年『国際精神分析学会』創立時、フロイトはユングを初代会長に就任させ、個人的にもしばらく蜜月状態ともいうべき時期が続いたが、無意識の範囲など学問的な見解の違いから両者はしだいに距離を置くようになり、1912年には訣別（フロイト56歳、ユング37歳）し、1914年にはユングは国際精神分析学会を脱退した。