高等専門学校のうち、工業高等専門学校（工業高専）の数が最も多く、工業高等専門学校には、機械、電気・電子、制御情報、物質（化学系）、材料、環境都市、建築、デザイン等の学科がある。工業高等専門学校（工業高専）は、工専と略されることもあるが、旧制の工専（工業専門学校）と混同される可能性があり、一般的には高専と略す。そのほか、商船高等専門学校（商船高専）、電波工業高等専門学校（電波高専）、航空工業高等専門学校（航空高専）などがある。

商船高等専門学校、電波工業高等専門学校は国立の商船高等学校（3年制）や電波高等学校（3年制）を5年制の高等専門学校に改組したもので、大半の工業高等専門学校とは出自が異なる。以前は工業と商船（海員養成）の分野しか認められていなかったが、平成3年、高等専門学校設置基準の改正で工業と商船に限った専門分野の縛りがなくなり、北海道に芸術系の高等専門学校が創設された（札幌市立高等専門学校、但し、2006年4月に札幌市立大学へ組織変更されるため、廃校になることが決まっている。）。しかし旧制七年制高等学校のような、教養教育系の高等専門学校は、いまだに設置された事例がない。