2004年現在日本の総人口の約1%がキリスト教徒である。そのうちカトリックが約45万人、プロテスタント諸派が計約65万人、プロテスタントで最も信徒数の多い日本基督教団が約10万人である。正教会（日本ハリストス正教会）は約2.5万人。尚、異端とされる教派についても言及すると、末日聖徒イエス・キリスト教会（モルモン教）が公称約12万人、最大勢力とされるエホバの証人が約22万人とされている。通常この2派は正統派の立場からはキリスト教徒総人口には含めない。

20世紀後半以降の日本はクリスマスやバレンタインデーのように年中行事として、或いはキリスト教会での結婚式の選択やキリスト教系ミッションスク－ル人気などの形で純粋な信仰とは別にキリスト教の文化・行事が国民の間に浸透しつつある<ref>これはキリスト教に限らず仏教・神道・儒教も同じで、浸透の色合いとしては仏教・神道に次ぐ。</ref>。