つくば市の就業者のうち、第一次産業従事者は5,388人、第二次産業従事者は20,170人、第三次産業従事者は64,972人である（2000年現在）。

研究学園地域以外では農業も行われており、特に筑波山麓で収穫される「北条米」は昭和初期に皇室への献上米になるなど高級米として有名である。また、畑面積の約3分の1を占める芝は日本一の作付面積（2,245ha）を誇る。近年では、摘み取り園式のブルーベリー栽培が行われるなど、新しい形の農業にも取り組んでいる。また、日本で唯一搾菜の栽培が行われ、有名中華料理店などに出荷されたり、たまり漬として加工されている。

つくばエクスプレスの開通に伴い、首都圏からの筑波山への観光客が増加している。また市内にはパン屋が多く、近年「パンの街つくば」として振興を図っている。