分類上は単維管束亜属（ゴヨウマツ）と複維管束亜属（ニヨウマツ）に分けられる。

日本に自生する五葉松類として以下の4種及び1変種がある。

• ヒメコマツ（別名ゴヨウマツ） Pinus parviflora
• キタゴヨウ（ヒメコマツの変種） P. parviflora var. pentaphylla
• ヤクタネゴヨウ P. armandi var. amamiana
• チョウセンゴヨウ P. koraiensis
• ハイマツ P. pumila

日本に分布する二葉松類としては以下の3種類がある。

• アカマツ P. densiflora
• クロマツ P. thunbergii
• リュウキュウマツ P. luchuensis