トイレを装備しているが、当時の輸送機にはまだ多かった蓄積方式（いわゆる汲み取り構造で、消毒・消臭液を汚物タンク部に溜めてある）を採用しており、便器に水を流す設備はなかった。汚物の液体分だけを漉し取って消毒液を混ぜ、便器の水洗に利用する「循環式」は、YSでは採用に至っていない。トイレ内の照明はかなり暗めに設定されていた。

荷物搭載スペースが座席上部に存在するが、ここには帽子ぐらいの大きさのものしか収納できないことになっていたために、大きな荷物は搭乗前に手荷物として預けるか、座席の下に置く必要があった。機内の照明には丸型の蛍光灯が使用されており、一昔前のバスを思わせる内装となっていた。海外で活躍している機体もほぼ機内は無改造のまま使用されていることが多く、カーゴ設備や機内サービス器具、座席上部の読書灯などにその名残を見ることが出来る。

<gallery> 画像:Retired YS11 Cockpit.JPG|コックピット 画像:Ys-kinai.jpg|機内 画像:YSHIJOGUCHICHUIGAKI.jpg|非常口注意書き 画像:YSDOKUSHOTOANDYOBIDASI.jpg|読書灯とCA呼び出しボタン 画像:YSrestroom.JPG|化粧室 画像:YSpropeller.JPG|プロペラ </gallery>