イージス・システムでは、従来のスタンダード・ミサイルを改良したスタンダード・ミサイル2型（SM-2）を使用する。これは、発射してから目標に接近するまでの中途航程に慣性誘導・指令誘導を導入している。飛翔中のミサイルは慣性誘導によってコースをとり、目標に動きがあったときは適宜SPY-1レーダーより指令誘導を受けることになるので、射撃指揮装置はその間ほかのミサイルを誘導することができる。これによって、射撃指揮装置の数以上の目標を同時に攻撃できることになり、同時に対処できる目標の数が飛躍的に増加し、タイコンデロガ級で15、アーレイバーク級では12程度と言われている。また、より効率的な飛翔ルートをとれるようになったため、射程も増大した。