劇場版3部作のDVDは2000年に「特別版」として発売された。特別版として発売するにあたり、映像はそのままに、音声に対しては5.1チャンネル用に、オリジナルキャスト（一部を除く）によるアフレコのやり直しや効果音、BGMの細かい変更が行われた。後に劇場版公開当時のオリジナル音声版DVDが2007年12月に発売されている。

その後、TV版の映像を収録したDVD-BOXが初回限定生産として、2006年12月にDVD-BOX1（第1～24話収録：6枚組）、翌2007年1月にDVD-BOX2（第25～43話収録：5枚組）の全2巻に分けて発売された。単巻（全11枚）でも2007年6月から順次発売された。DVD-BOX1の予約者に対し、非売品の特製アクションモデル「1/200 RX-78 GUNDAM Limited Version」が付く先行予約特典キャンペーンを行っている。このDVD化にあたっては監督の富野自ら、本放送から約27年近く経過した原版フィルムの劣化部分のデジタル補正作業や、ハイビジョン仕様のリマスター制作に関るほど、大規模なリファイン作業が行われた。