名古屋本線内の豊橋駅 - 岐阜駅間に下りは一部特別車の特急で、上りは一部特別車の快速特急で、それぞれ2本ずつ運行している。基本停車駅での全区間標準所要時分は快速特急が75分（名岐間25分・名豊間49分）、特急が79分（名岐間26分・名豊間52分）となっている。いずれも1998年頃における最短時分に比べて2 - 3分程度余裕時分が加えてある。この系統は昔から1200系の6両または1800系を増結した8両で運転されてきたが、最近は2200系（1700-2300系を含む。増結車は3100系または3150系）による運用も増えた。区間列車として下りは名古屋止まり（平日は豊橋発と豊川稲荷発と後述の西尾発が各1本、休日は西尾発が1本のみ運転。豊川稲荷発の列車のみ美合駅にも停車）、上りは国府止まり（深夜に岐阜発の1本のみ）や伊奈止まり（深夜に2本（休日は1本）のみで美合駅にも停車）がある。快速特急・特急とも標準停車駅と新木曽川駅・笠松駅にのみ停車する列車がほとんどだが、朝や深夜は豊橋口で急行を補完するため、伊奈駅や国府駅に停車する列車もある。平日朝に岐阜駅7：28発特急豊橋行きの1本だけ、鳴海駅にも停車する。