農学研究科(のうがくけんきゅうか)は、大学院の研究科のうち、農学分野を主とするものである。一部の大学大学院では、工学や理学分野とともに自然科学研究科として開設されている。類似の研究科として農学生命科学研究科、生物資源科学研究科、生物資源学研究科などがある。