軍旗（ぐんき）とは、広義においては、軍隊が国軍又は部隊を表章する旗章を指す。狭義においては、陸軍の連隊のそれを指す。海軍のそれについては「軍艦旗」を参照。

近代的軍隊創設以降は伝統的に連隊を恒久の基本的部隊単位としてきたことから（詳しくは連隊参照。）、連隊ごとに授与されるものが有名で連隊旗とも通称される。大日本帝国陸軍においては、連隊に授与される旭日旗を「軍旗」と呼称した。陸上自衛隊では自衛隊旗という。