襟鞭毛虫(えりべんもうちゅう、choanoflagellate)は小さな単鞭毛の鞭毛虫で、単細胞生物の中では我々動物などの後生動物に最も近いとされる。名前の「choano-」はギリシア語で襟(choanos)を意味する。およそ50属150種ほどが記載されている。