行政機関（ぎょうせいきかん）は、行政の事務を担当する機関のことであり主要な公共機関のひとつ。主に国の行政事務を担当する機関を指すが、地方公共団体の自治行政の事務を担当する機関を含めることもある。立法機関（立法府）、司法機関（裁判所）と対比される。国と地方公共団体の行政機関を総称して行政庁（下記の講学上の概念とは異なる）ともいう。