科学捜査研究所（かがくそうさけんきゅうしょ）とは、都道府県警察本部の主に刑事部に設置される機関。科学捜査の研究および鑑定を行う。略称は「科捜研（かそうけん）」。

犯罪現場の残された物的証拠は、事件・事故の真相を解明し犯人の逮捕を行う為の大きな手掛かりになるばかりでなく、訴訟手続上重要な証拠にもなるため、犯罪捜査の上で重要な役目を担う部署である。科学捜査研究所では、DNA鑑定をはじめ、銃器、音声、文書の鑑定や麻薬・覚せい剤等の分析を行っている。科学警察研究所と混同されがちだが、科警研が警察庁の付属機関で技術開発や政策立案を主にしているのに対して、各都道府県警察本部の付属機関である点が異なる。