別当（べっとう）は、本来、本官を持つ者が他の管轄の役職を持つ場合に、それを補佐する役職名。このことから転じて、以下のような複数の意味を持つ。

• 律令制度の下で、令外官として設置された検非違使庁や蔵人所などの責任者。機関の統括責任者ではあるが、所内部の実務については頭が指揮しており直接関与しなかった（例えば、検非違使別当は検非違使庁そのものは統括するが検非違使ではなく、同様に蔵人所別当も蔵人所を統括するが蔵人ではなかった）。対外的な責任者であるとともに、天皇・太政官との連絡にあたった。後には一部の寮・司にも別当が設置された。
• 平安時代以降の院、親王家、摂関家の政所の長官。鎌倉幕府の政所、侍所、公文所などの長官。
• 武蔵国の勅旨牧の管理者のこと。なお、その他の国には牧監が置かれた。
• かつての厩務員の呼称。
• 東大寺、興福寺、四天王寺などの諸大寺で、寺務を司る者。なお、僧侶身分では無い者が別当に就任した場合にはそれを「俗別当（ぞくべっとう）」と呼ぶ。
• 神宮寺の寺務を司る者。検校に次ぐ。別当がそこに住んだことから神宮寺の一部を別当寺とも言う。それを指す場合もある。
  • 熊野別当
• 上記諸大寺や神宮寺、門跡寺院において、別当・門跡などの責任者に近侍した坊官の中における最高の地位。
• 当道座における盲人の官位の1つ。検校に次ぐ。
• 日本人の姓の1つ。別当薫（元プロ野球選手）など