ミサイル巡洋艦（ミサイルじゅんようかん）とは軍艦の艦種の一つで、ミサイルを搭載している巡洋艦の事である。主にアメリカ合衆国とソ連・ロシアで開発・運用されているが、両国においてその性格は異なっている。