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本項では、日本プロ野球の内、主に日本野球機構／日本プロフェッショナル野球組織（NPB）のコミッショナーについて記述していく。

NPBにおける最高責任者であり、かつ最高の権限を有する。社団法人日本野球機構における会長でもある。

NPB以外では、四国・九州アイランドリーグが2004年に四国アイランドリーグとして発足した当初から、石毛宏典が務めていたが、2007年12月に辞任。2009年より新たに発足した関西独立リーグの同職に就いている。