カール・ミュンヒンガー（Karl Münchinger, 1915年5月29日－1990年3月13日）は、ドイツの指揮者。

シュトゥットガルトに生まれ、シュトゥットガルト音楽院を経てライプツィヒでヘルマン・アーベントロートに指揮を学ぶ。

シュトゥットガルトでオルガニスト兼合唱指揮者としてキャリアをスタートし、1941年にハノーヴァーのニーダーザクセン国立管弦楽団の指揮者となった。 1945年にシュトゥットガルト室内管弦楽団を結成、バッハなどのバロック音楽の清新な演奏で世界的名声を得た。1961年にはこの室内管弦楽団を45名編成のオーケストラに拡大したシュトゥットガルト・クラシック・フィルハーモニーを組織するが、こちらの試みは成功しなかった。晩年はシュトゥットガルト室内管弦楽団からも離れ、不遇であった。

いわゆるバロック音楽の演奏家としてその普及に努めた。ヴィヴァルディの四季などポピュラーなもので大変成功したが、その録音をたどる限りバッハ演奏に力をいれていたと言うことができる。　特に4大宗教曲（マタイ受難曲、ヨハネ受難曲、ロ短調ミサ、クリスマス・オラトリオ）は全てエリー・アメリンクをソプラノ独唱に採用して録音し、成功を収めた。　またフーガの技法、音楽の捧げものなど晩年の作品を弦楽合奏を中心として演奏し、現在でも典型的な解釈のひとつとされている。