みどりの窓口（みどりのまどぐち）とは、マルス端末が設置されているJR線（鉄道）の乗車券類（乗車券・特急券・指定券など）やJRバスの座席指定制の路線（ドリーム号、昼特急など）の乗車券・指定券を発券する窓口である。駅務室に窓を設けただけの小さなものから、ターミナル駅の大規模な窓口までその形態は様々である。利用者の少ない駅では窓口専任の係員がおらず有人改札の係員が窓口業務を兼務している。 JRの主な駅の他、北近畿タンゴ鉄道・土佐くろしお鉄道など旧・国鉄から転換した第三セクター鉄道の主な駅、大手旅行会社、空港、バスターミナル、港のフェリーターミナルなどにもある。

また、1988年3月12日までは座席指定券類の他に青函連絡船による自動車航送予約も引き受けていた。その際、航送当日に桟橋窓口に車検証を持参し、乗船名簿記入が必要だった。

「みどりの窓口」という名称の由来は、この窓口で発券される切符の地紋が常備券の赤に対して、薄い緑色をしていた事によると言われている。その後1990年代後半からは水色の地紋に変わっており、偽造防止を兼ねて濃い水色の帯と「JR」マークのホログラムを施している。